Muitos usuários tem dificuldades com o GNU/Linux por que não terem uma visão geral sobre o que está guardado em que local. Falaremos um pouco da organização de diretórios e arquivos do Linux.
VEJA TAMBÉM:
Visão geral da organização dos arquivos no Linux
A grosso modo, pode-se dizer que, no Linux tudo é arquivo. Se há algo que não seja um arquivo, então este algo é processo. No GNU/Linux (como no UNIX), não há diferença entre arquivo e diretório, uma vez que um diretório é apenas um arquivo contendo nomes de outros arquivos.
Todos estes arquivos estão organizados de acordo com uma hierarquia, isto é, há critérios que prevêm os principais diretórios e seu conteúdo. Estes critérios são definidos por um padrão, o FHS (Filesystem Hierarchy Standard).

No topo da hierarquia de arquivos fica o chamado diretório raíz (ou, mais apropriadamente o diretório root), pois a estrutura de diretórios é chamada também de “Árvore de Diretórios”.